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RACE(rapid-amplification of cDNA ends)是通过PCR进行cDNA末端快速克隆的技术。 RACE是基于PCR技术基础上由已知的一段cDNA片段,通过往两端延伸扩增从而获得完整的3'端和5'端的方法. 近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)是一种基于PCR从低丰度的转录本中快速扩增cDNA的5'和3'末端的有效方法,以其简单、快速、廉价等优势而受到越来越多的重视。
服务编号 |
服务项目 |
收费标准 |
实验周期 |
备注 |
NLS-013 |
3′ RACE |
2000元(600碱基以内)超过部分1.5元/bp |
15-20个工作日 |
包括特异引物的设计合成,RACE PCR,以及克隆测序。 |
NLS-014 |
5′ RACE |
2500元(600碱基以内)超过部分2元/bp |
20-25个工作日 |
备注1. 对于样品中含量低的基因,我们可以使用特殊方法进行5′ RACE,具体定价。
2. 实验周期指RACE扩增长度为基础长度时所需的时间;样品特殊、样品个数多和使用特殊方法时,实验周期顺延。
技术原理:
3'-RACE的实验原理及流程:利用mRNA的3'末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以连有SMART寡核营酸序列通用接头引物的Oligo(dT)30MN作为锁定引物反转录合成标准第一链cDNA.然后用一个基因特异引物GSP1(gene specific primer,GSP)作为上游引物,用一个含有部分接头序列的通用引物UPM(universal primer,UPM)作为下游引物,以cDNA第一链为模板,进行PCR循环,把目的基因3' 末端的DNA片段扩增出来。(见Figure 1)
Figure 1
5'-RACE的实验原理及流程:先利用mRNA的3'末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准第一链cDNA.利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到第一链的5'末端时自动加上3-5个(dC)残基,退火后(dC)残基与含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接头引物配对后,转换为以SMART序列为模板继续延伸而连上通用接头(见Figure 2 )。然后用一个含有部分接头序列的通用引物UPM(universal primer,UPM)作为上游引物,用一个基因特异引物2(GSP 2 genespecific primer,GSP)作为下游引物,以SMART第一链cDNA为模板,进行PCR循环,把目的基因5'末端的cDNA片段扩增出来。最终,从2个有相互重叠序列的3'/ 5'-RACE产物中获得全长cDNA,或者通过分析RACE产物的3'和5'端序列,合成相应引物扩增出全长cDNA。
Figure 2.
服务内容:
1. 总RNA的提取及定量
2. RNA反转录
3 . RACE PCR实验
4. 结果分析
5. 实验报告整理
客户提供:
1. 提供细胞或组织标本,同时应保证材料新鲜,动物细胞数为106个以上,动物组织为50 mg以上,如提供RNA模板,需保证模板质量且不小于10mg.
2. 提供检测基因的序列信息及相关文献资料。
结果内容:
1. 扩增电泳图
2. 全长CDNA序列及测序报告
3. RACE实验步骤、使用仪器、引物序列等
服务说明:
1. 样品:请尽量提供目的基因表达量高的单一样品。
2.提取Total RNA的材料要新鲜样品(组织为100-150 mg/样,细胞>106个/样),若为冻存样品,请于-70℃以下保存并自备干冰以便运输。
3.Total RNA无降解,OD260/280=1.8 ~ 2.0。
4.请提供尽量多的实验材料:3′ RACE Total RNA>15 μg;5′RACE Total RNA>25 μg。如果基因的含量较低或者未知序列较长,样品量需相应增加。
对于已知序列:
1. 请提供大于200 bp的已知序列(请注明已知序列的5′ 端及3′端);如果已知序列比较短,建议先进行3′ RACE再进行5′ RACE,以提高实验的成功率。
2. 如果您有实验数据和参考文献等,也请发送给我们,这将会帮助我们更好地理解您的实验背景,有利于实验的顺利进行。
3. 我们会根据已知序列进行特异性扩增,如果得不到目的序列或为非目的基因的序列,我们将停止实验并收取实验成本费用。如果得到序列与您提供的序列有个别碱基不符,我们在征求您的意见后决定是否进行RACE实验。
4. 经验证,样品中基因含量低时,我们将与您沟通后,决定下一步实验使用的方法。
5. 由于mRNA存在个体和组织差异或基因的序列特殊,RACE的PCR产物测序有时会有个别碱基是套峰或测不通的情况,对未测通部分可继续进行克隆测序,最终提供两个质粒的测序结果,碱基的准确性由您自行判断。
6. 如果您的样品为原核生物,我们不保证调取的序列为3′ 和5′端全长序列。
服务要求:
请认真填写荧光定量PCR检测技术服务委托单,并联系技术人员将委托单发送至:support@novland.com.cn。
《RACE(3’,5’)-PCR技术服务合同》下载
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